Метод спостереження дає можливість аналізу описувати біологічні явища. Для того суть явища, необхідно перш за все фактичний матеріал та описати його. Цей значно поширений у зоології, ботаніці, екології та інших науках.

Порівняльний метод дозволяє через порівняння вивчати подібність і відмінність організмів та їхніх частин. На його принципах заснована систематика, створена клітинна теорія.

Історичний метод з'ясовує закономірності появи та розвитку організмів, становлення їхньої структури та функції.

Експериментальний метод пов'язаний зі створенням ситуації, яка допомагає досліджувати властивості та явища живої природи. Цей метод дозволяє вивчити явища ізольовано й домогтися їх повторюваності під час відтворення експериментальних умов. Експеримент забезпечує глибше, порівняно з іншими методами, проникнення у суть явища.

Моделювання — це метод вивчення явища або процесу через відтворення його самого або його